Accueil de formations proposées par le District.
En 1997, un second stade (stabilisé) est inauguré aux Merisiers, ce qui permet d’améliorer les conditions d’entraînement et de compétitions pour l’ensemble des catégories.
Au départ de Didier GUILLABERT pour des responsabilités au niveau du District, deux présidents se succèdent : Michel PETITJEAN (1999 – 2001) et Jean Noël HOARREAU (2001 – 2002).
Patrice MERLE prend la suite de 2002 à 2004 et poursuit le travail de renforcement des structures et de continuité de l’état d’esprit qui anime le club depuis le début : qualité et convivialité.
De 2004 à 2006, c’est au tour de Bernard LEPVRIER d’accéder à la présidence. Quelques difficultés le font renoncer en février 2006 et c’est un duo, Rachid SAMMAH et Jacky DENIS qui assurent une co-présidence jusqu’en mai 2006.
Jean Marc DESCHODT est alors élu ; il restera jusqu’en octobre 2009 ; il verra l’inauguration du terrain synthétique aux Merisiers (juin 2007) et l’équipe fanion du FC JOUY LE MOUTIER remporter la coupe du Val d’Oise « 95+ » en 2008.
C’est Gérard LETESSIER, responsable jusque là de l’école de football, qui reprend le flambeau en novembre 2009. Il est l’actuel président.